四極桿GC/MS上如何測(cè)定精確質(zhì)量和分子式
質(zhì)譜上的精確質(zhì)量數(shù)對(duì)測(cè)定化合物的分子式至關(guān)重要,,通常這一功能是在高分辨質(zhì)譜(TOF、Orbitrap等)上實(shí)現(xiàn),,但實(shí)際上,,在四極桿的GC/MS或LC/MS上,通過(guò)正確的質(zhì)量校正和質(zhì)譜峰形校正后,,同樣可以實(shí)現(xiàn)精確質(zhì)量數(shù)的測(cè)定,。
在之前的幾期文章中,我們已經(jīng)介紹了精確質(zhì)量數(shù)對(duì)未知物分析的一些案例,,今天我們以GC/MS為例,,詳細(xì)介紹MassWorks在低分辨質(zhì)譜上實(shí)現(xiàn)對(duì)化合物精確質(zhì)量數(shù)和分子式測(cè)定的過(guò)程。
數(shù)據(jù)采集模式
傳統(tǒng)的全掃描模式采集的都是棒狀圖(Centriod),,它是無(wú)法測(cè)定精確質(zhì)量數(shù)的,,要實(shí)現(xiàn)在GC/MS上的精確質(zhì)量數(shù)測(cè)定,需要將數(shù)據(jù)采集模式變更為連續(xù)的輪廓圖(Profile)模式,。
采集的數(shù)據(jù)包括校正數(shù)據(jù)和樣品數(shù)據(jù),,校正樣品可以直接使用GC/MS的調(diào)諧氣,通過(guò)編程即可實(shí)現(xiàn)校正標(biāo)樣的采集,。
1. 安捷倫GC/MS的數(shù)據(jù)采集方式
如圖1所示,,在MassHunter工作站中,將Acquisition Type選中為“Profile”模式,,并將儀器的采集閾值設(shè)定為“0”,。
校正標(biāo)樣可以使用GC/MS的調(diào)諧氣,在Timed Events表中,,設(shè)置EI Calibration Valve 的開(kāi)關(guān)時(shí)間,,只需開(kāi)其0.5-1min時(shí)間即可。
圖1:MassHunter上的采集參數(shù)設(shè)定
2. 島津GC/MS的數(shù)據(jù)采集方式
如圖2所示,,在GCMSsolution工作站中,,將在Option菜單中,將Profile Export中的選項(xiàng)設(shè)定為“CRN format”,,然后再編輯GC/MS的采集方法即可,。
圖2:GCMSsolution上的采集模式設(shè)置
若需要對(duì)校正用的調(diào)諧氣進(jìn)行采集,可在MS Program中,,設(shè)定PFTBAOpen的時(shí)間,,見(jiàn)圖3。
圖3:島津GC/MS的PFTBA采集時(shí)間設(shè)定
3. 賽默飛GC/MS的數(shù)據(jù)采集方式
如圖4所示,,變色龍軟件上,,Scan列表中,將Data type切換為“Profile”,需要注意是,,勾選Acquisition Threshold并設(shè)定為“0”,。
如果需要采集PFTBA調(diào)諧氣標(biāo)樣,在Groups列表中,,設(shè)置Calibration Gas的開(kāi)關(guān)時(shí)間,,如圖4紅色方框所示。
圖4:賽默飛GC/MS的數(shù)據(jù)采集參數(shù)設(shè)置
數(shù)據(jù)校正及分析
1. PFTBA校正精確質(zhì)量
數(shù)據(jù)采集完成后,,在MassWorks軟件的Calibaration界面中打開(kāi)調(diào)諧標(biāo)樣PFTBA的質(zhì)譜數(shù)據(jù),,選中幾個(gè)標(biāo)樣離子,并輸入其化學(xué)式,,執(zhí)行精確質(zhì)量和峰形校正,。校正的結(jié)果應(yīng)該滿(mǎn)足如下條件:
1)質(zhì)量誤差Δm(mDa),數(shù)值應(yīng)該控制在個(gè)數(shù)為以?xún)?nèi),,建議< 5mDa,;
2)譜圖準(zhǔn)確度Spectrum Accuary,應(yīng)大于98,。
校正通過(guò)后,,保存該校正文件。
圖5:PFTBA的數(shù)據(jù)校正結(jié)果
2. 樣品數(shù)據(jù)的精確質(zhì)量及分子式測(cè)定
在MassWorks軟件的Analysis界面中,,打開(kāi)樣品數(shù)據(jù),并調(diào)用之前的校正文件,,即可實(shí)現(xiàn)對(duì)樣品數(shù)據(jù)的自動(dòng)校正,。
如圖6右上圖為八氟萘標(biāo)樣的總離子流圖,選中的峰即為八氟萘,,圖6右下圖為八氟萘的平均質(zhì)譜圖,。
圖6: MassWorks中打開(kāi)樣品數(shù)據(jù)
從圖6中,我們可以看到,,所有的離子的測(cè)定質(zhì)量數(shù)均顯示為小數(shù)點(diǎn)后四位,,這些數(shù)值即為對(duì)應(yīng)離子的實(shí)測(cè)精確質(zhì)量數(shù)。
對(duì)要分析的目標(biāo)離子,,我們選中它的頂部的精確質(zhì)量數(shù),,然后調(diào)用CLIPS Search功能,設(shè)定分子式分析的參數(shù),,包括可能的元素,、質(zhì)量誤差Mass Tolerance、電荷狀態(tài)Electron State,、不飽和度DBE,、同位素輪廓Profile Mass Range,如圖7所示。
圖7:CLIPS Search參數(shù)設(shè)置
點(diǎn)擊Search得到其分子式的分析結(jié)果,,如圖8所示,。從結(jié)果可以看出,實(shí)測(cè)的精確質(zhì)量數(shù)為271.9852,,而八氟萘的理論精確質(zhì)量為271.9867,,絕對(duì)質(zhì)量誤差為-1.477mDa,相對(duì)質(zhì)量誤差為-5.43 ppm,。譜圖準(zhǔn)確度Spectral Accuracy的打分為99.76,,為所有候選分子式的第一名,正確的對(duì)八氟萘的分子式進(jìn)行了識(shí)別,。
圖8:分子式測(cè)定結(jié)果
小結(jié)
精確質(zhì)量數(shù)測(cè)定可以幫助我們對(duì)那些譜庫(kù)中不存在或新發(fā)現(xiàn)的未知物鑒定提供幫助,,通過(guò)精確質(zhì)量數(shù),得到全部離子的分子式,,再結(jié)合確定的分子離子和特征碎片離子的元素組成,,我們就可以對(duì)未知化合物的可能結(jié)構(gòu)進(jìn)行推導(dǎo)。(詳情請(qǐng)閱讀:如何在GC/MS上通過(guò)精確質(zhì)量數(shù)鑒定未知化合物)
MassWorks的這一特殊的功能,,可以讓現(xiàn)有GC/MS和LC/MS的工作潛力發(fā)揮到最大,,即使沒(méi)有高分辨質(zhì)譜,我們依然可以為香精香料,、天然產(chǎn)物,、藥物雜質(zhì)、化學(xué)合成,、新型環(huán)境污染物中的未知物分析提供幫助,。
關(guān)于MassWorks 軟件
MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開(kāi)發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們?cè)诘头直媛实乃臉O桿GC/MS,、LC/MS直接測(cè)定化合物的精確質(zhì)量,,并通過(guò)獨(dú)有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF,、Orbitrap)的定性分析,。
關(guān)于綠綿科技
綠綿科技是Cerno Bioscience公司在中國(guó)區(qū)的總代理商,負(fù)責(zé)Cerno公司旗下的MassWorks,、GC/ID 等產(chǎn)品市場(chǎng)推廣,、銷(xiāo)售、售前/售后技術(shù)支持,、應(yīng)用支持,。
若您想了解獲取 MassWorks 產(chǎn)品的更多信息或應(yīng)用,歡迎致電綠綿科技,!
關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡(jiǎn)稱(chēng):綠綿科技)以體現(xiàn)客戶(hù)服務(wù)價(jià)值為宗旨,,以專(zhuān)業(yè)精神和技能為廣大實(shí)驗(yàn)室分析工作者提供樣品前處理,、樣品制備及分析、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,,致力于協(xié)助客戶(hù)提高分析檢測(cè)的效率和水平,。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話(huà):010-82676061/2/3/4/5/6/7/8
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