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如何在GC/MS上通過精確質(zhì)量數(shù)鑒定未知化合物

關(guān)鍵詞:GC/MS 精確質(zhì)量數(shù) 未知化合物
時間:2024-07-16 15:53:53

  在GC/MS鑒定未知物時,,在NIST、Wiley等商業(yè)化的標準數(shù)據(jù)庫是最常用的工具,,通過正,、反檢索匹配,來確定目標物的可能結(jié)構(gòu)信息,,但標準譜庫并不是收錄了全部的化合物,。我們在一些應用場景中,如香精香料,、天然產(chǎn)物的分析中,,偶爾會遇到譜庫檢索不到的化合物。

  MassWorks軟件的 TrueCal?校正技術(shù),,可以幫助現(xiàn)有的單四極桿GC/MS和三重四極桿GC/MSMS直接測定化合物精確質(zhì)量數(shù),,可以做到像高分辨TOF或Orbitrap那樣將質(zhì)量數(shù)精確至0.000x Da,,再通過CLIPS功能對離子的元素組成進行確定。

  下面我們將以一個含S化合物為例,,演示MassWorks軟件在GC/MS上實現(xiàn)對其進行精確質(zhì)量測定,、元素組成分析,甚至是可能的結(jié)構(gòu)解析,。

  示例:GC/MS上的未知物鑒定

  1. GC/MS數(shù)據(jù)采集:

  樣品信息:MS校準調(diào)諧氣PFTBA (安捷倫GC/MSD自帶),,樣品為某公司提供的香精樣品。

  質(zhì)譜條件:PFTBA和香精樣品均在Chemstation工作站軟件下以Row Scan(原始掃描)模式采集,,質(zhì)量范圍為 m/z 35-450,,離子閾值Treshold設置為零。MS源溫度230℃,,四極桿溫度150℃,。

  色譜柱:Agilent 19091S-133 HP-5MS,30 m×250um,,

  數(shù)據(jù)分析: MassWorks? V6.0 軟件(Cerno Bioscience公司)對MS數(shù)據(jù)進行精確質(zhì)量和譜圖準確度測定,。

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  圖1:通過PFTBA完成MS的精確質(zhì)量和譜圖校正

  樣品待分析的目標峰的保留時間為Rt=12.978min,選取保留時間范圍12.9595min-12.9967min,,如圖2(上)所示,,提取該化合物平均質(zhì)譜圖,圖2(下)顯示了MassWorks軟件校正后該化合物所有離子的精確質(zhì)量數(shù),。

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  圖2:經(jīng)MassWorks校正后的樣品數(shù)據(jù)

  2. 數(shù)據(jù)分析:

  鑒定分子離子(M+)

  從圖2的質(zhì)譜圖中,我們可以看到m/z=178.0835的離子為該化合物的分子離子峰,,放大質(zhì)譜圖后,,我們通過A+2處(m/z=180.0870)的同位素分布信息(見圖3),可以判定,,該化合物為含S的化合物,。

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  圖3 離子m/z =178.0835的精確質(zhì)量數(shù)及同位素輪廓分布

  在MassWorks中,并設定CLIPS的檢索條件,,對m/z=178.0835離子的元素組成進行檢索分析,。如圖4所示,將元素組成設定為C,、H,、O、N,、S五種元素,,質(zhì)量誤差設定為20 mDa,電荷狀態(tài)限定為奇電子離子“Odd”,,同位素輪廓分布的起點和終點分別為“ -0.5 Da”和“2.5 Da”,。

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  圖4 MassWorks分析時CLIPS檢索的參數(shù)設置

  離子m/z=178.0835共得到了19個分子式,,圖5(上)顯示了其中“同位素譜圖準確度(Spectral Accuracy)”最高的前6個分子式。排名第一的分子式,,譜圖準確度高達99.08,,排名第二的分子式的譜圖準確度僅為97.12,從譜圖準確度的打分我們可以確定該化合物的分子式即為C8H18S2,。

  圖5(中)顯示了C8H18S2的理論同位素和校正譜圖同位素輪廓分布的完美擬合,,圖5(下)中可以觀察到C7H14O3S的理論同位素分布在A+2處明顯低于校正譜圖,原因就在于S原子的個數(shù)少了1個,。

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圖5:按譜圖準確度排序產(chǎn)生的候選分子式的CLIPS檢索結(jié)果列表(上圖),,第一個候選分子式(中圖)和第二個(底圖)的校正譜圖(紅色)與理論譜圖(藍色)的疊加.

  主要碎片離子的元素組成確定

  采用同樣的方式,我們可以逐一對碎片離子的分子式進行確定,,主要的特征碎片離子的分子式鑒定結(jié)果見圖6,。

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  圖6:主要碎片離子的分子式鑒定結(jié)果(從上至下,精確質(zhì)量數(shù)依次為m/z = 122.0059,、m/z = 92.9985,、m/z = 89.0103、m/z = 57.0766,、m/z = 44.9992,、m/z = 41.0626)

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  圖7:主要離子的精確質(zhì)量及分子式

  可能的結(jié)構(gòu)式

  該化合物分子式C8H18S2的不飽和度(DBE)=0,我們可以得到的信息是,,該化合物不含雙鍵和環(huán),,因此它的結(jié)構(gòu)要么是直鏈,要么帶支鏈,。

  通過C4H10S2,、C4H8S、C2H5S2,、C4H9這四個碎片的元素組成,,我們大致可以推斷出,兩個S原子是直接相連的,,兩個“C4H9”的飽和烷基基團分別兩個S原子的兩端,。

  要產(chǎn)生如圖7所示的質(zhì)譜圖,大概有三種可能的結(jié)構(gòu),,但目前的質(zhì)譜信息還不足以區(qū)分是哪一種結(jié)構(gòu),,后續(xù)的分析可以借助NMR法來幫助確定。

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  圖8:可能的結(jié)構(gòu)式

  需要注意的是,,在EI電離的模式下,,分子離子峰有可能被完全打碎,而使得未知化合物的質(zhì)譜譜圖中不能找到分子離子,,這種情況下,,就需要考慮用軟電離的模式,,如CI、FAB等電離方式,,來獲取分子離子,,再在MassWorks軟件中測定其精確質(zhì)量及分子式。

  關(guān)于MassWorks 軟件

  MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,,能幫助我們在低分辨率的四極桿GC/MS,、LC/MS直接測定化合物的精確質(zhì)量,并通過獨有的譜圖準確度概念確定出準確的分子式,。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF,、Orbitrap)的定性分析。

  關(guān)于綠綿科技

  綠綿科技是Cerno Bioscience公司在中國區(qū)的總代理商,,負責Cerno公司旗下的MassWorks,、GC/ID 等產(chǎn)品市場推廣、銷售,、售前/售后技術(shù)支持,、應用支持。

  若您想了解獲取 MassWorks 產(chǎn)品的更多信息或應用,,歡迎致電綠綿科技,!

關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務價值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實驗室分析工作者提供樣品前處理,、樣品制備及分析,、實驗數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測的效率和水平,。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8 E-mail:[email protected],。