如何在四極桿GC/MS上創(chuàng)建適用于NIST檢索的精確質(zhì)量譜庫(kù)
MassWorks的質(zhì)譜校準(zhǔn)技術(shù)已經(jīng)被證實(shí)能夠?qū)λ臉O桿GC/MS系統(tǒng)中的分子離子或碎片離子實(shí)現(xiàn)精確質(zhì)量數(shù)與元素組成測(cè)定,。這一通常僅在高分辨率質(zhì)譜儀上才具備的能力,現(xiàn)可與NIST譜庫(kù)檢索相結(jié)合,,以提高化合物鑒定的置信度,。
本文我們將介紹通過(guò)MassWorks校準(zhǔn)技術(shù)在低分辨質(zhì)譜上創(chuàng)建“GC/MS精確質(zhì)量譜庫(kù)”的新方法。不同于當(dāng)前NIST譜庫(kù)僅對(duì)分子離子和碎片離子采用整數(shù)質(zhì)量精度的方式,,這種新的譜庫(kù)方法將擴(kuò)大對(duì)無(wú)分子離子的化合物的應(yīng)用范圍,,還將通過(guò)添加所有碎片離子的精確質(zhì)量,增強(qiáng)對(duì)包含分子離子譜圖的譜庫(kù)檢索性能,,以獲得更加準(zhǔn)確的結(jié)果,。
精確質(zhì)量數(shù)據(jù)采集方法
圖1顯示了以安捷倫GC/MS為例的數(shù)據(jù)采集的設(shè)置方式,將GC/MS的采集方式選為輪廓(Profile)掃描模式,,采樣閾值Threshold設(shè)置為0,,然后采集樣品和PFTBA的數(shù)據(jù)。
在MassWorks軟件中打開PFTBA數(shù)據(jù)用于GC/MS精確質(zhì)量數(shù)校正,,然后將其應(yīng)用于樣品譜圖,,獲取GC/MS精確質(zhì)量譜圖。
圖1 安捷倫GC/MS數(shù)據(jù)采集的設(shè)置方式
創(chuàng)建“GC/MS精確質(zhì)量譜庫(kù)”
創(chuàng)建精確質(zhì)量GC/MS譜庫(kù)的包括三個(gè)主要步驟:①?gòu)腗assWorks導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖至NIST MS Search,、②對(duì)導(dǎo)出的譜圖進(jìn)行編輯,,③保存精確質(zhì)量譜圖至譜庫(kù)。
1. 從MassWorks導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖
從MassWorks向NIST MS Search導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖的操作很簡(jiǎn)單,。只需在MassWorks的質(zhì)譜譜圖窗口中單擊右鍵,,在彈出菜單(見(jiàn)圖2)中選擇“Library Search”,這時(shí)將執(zhí)行常規(guī)的NIST譜庫(kù)檢索,,精確質(zhì)量譜圖將從MassWorks導(dǎo)出至NIST MS Search,,如圖3所示,,頂部的譜圖是從MassWorks導(dǎo)入的精確質(zhì)量譜圖,下方的譜圖則為NIST庫(kù)中原有的整數(shù)質(zhì)量譜圖,。在圖3的左下方候選化合物列表窗口中選中正確的化合物,,接著繼續(xù)下一步譜圖編輯操作。
圖2 從MassWorks軟件導(dǎo)出精確質(zhì)量譜圖至NIST MS Search
圖3 NIST MS search中選中正確的化合物
2. 編輯“精確質(zhì)量譜圖”
1) 復(fù)制NIST譜庫(kù)目標(biāo)化合物的所有質(zhì)譜圖信息——將圖3右下方“化合物信息”面板中復(fù)制并粘貼至一個(gè)txt格式的記事文本中,,如圖4所示,。
圖4 粘貼化合物信息至txt文本
2) 點(diǎn)擊“Librarian”和“Names”標(biāo)簽,打開“Spectrum Information”窗口,。選中列表頂部的化合物譜圖,,然后點(diǎn)擊“ed”工具欄按鈕(見(jiàn)圖5),使Spectrum Information窗口出現(xiàn)(見(jiàn)圖6),。
圖5 Librarian界面中選中精確質(zhì)量譜圖
3)從txt記事本中選擇性地復(fù)制信息并粘貼到“Spectrum Information”窗口,,采用以下方式更新各字段內(nèi)容:
①粘貼化合物的“名稱”。
② 粘貼“CAS號(hào)”,。
③ 輸入分子式和分子量,。
④ 結(jié)構(gòu)式可由化合物的CAS號(hào)自動(dòng)獲取,,或者直接粘貼結(jié)構(gòu)圖
?、?在“other name”中粘貼化合物的其它名稱。
?、拊凇癈omments”中編寫定制消息,。
⑦點(diǎn)擊“Replace”(見(jiàn)圖6),,更新該化合物譜圖的所有信息,。
經(jīng)過(guò)編輯后,精確質(zhì)量譜圖現(xiàn)在擁有包括名稱,、分子式,、結(jié)構(gòu)等在內(nèi)的完整記錄,并在譜列表窗口頂部以更新后的名稱顯示,。
圖6 為精確質(zhì)量譜圖添加化合物信息
3. 保存“精確質(zhì)量譜圖”至目標(biāo)譜庫(kù)
在保存精確質(zhì)量譜圖前,,需要事先新建一個(gè)譜庫(kù),如圖7所示,,點(diǎn)擊“Create Library”按鈕,,為將要?jiǎng)?chuàng)建的譜庫(kù)命名,例如“AM_nist”。
圖7 新建精確質(zhì)量譜庫(kù)
在圖6中,,點(diǎn)擊“Add to library”按鈕,,從彈出窗口(見(jiàn)圖8)中選擇已創(chuàng)建的庫(kù),例如“AM_nist”,,點(diǎn)擊“OK”完成。
圖8 選擇譜庫(kù),,將精確質(zhì)量譜圖添加至新的譜庫(kù)
成功創(chuàng)建精確質(zhì)量譜庫(kù)后,,即可在MassWorks中對(duì)高質(zhì)量精度的GC/MS譜圖進(jìn)行化合物的精確檢索。在開始檢索之前,,需要通過(guò)“Library Search Options”將已創(chuàng)建的精確質(zhì)量庫(kù)納入搜索范圍,。在NIST MS Search的“Option”主菜單項(xiàng)中,選擇“Library Search Options”,,點(diǎn)擊“Libraries”標(biāo)簽,,選擇“am_nist”,然后點(diǎn)擊“ Add”添加精確質(zhì)量譜庫(kù)至檢索目標(biāo)庫(kù)(見(jiàn)圖9),。
圖9 選擇精確質(zhì)量譜庫(kù)用于檢索
精確質(zhì)量譜庫(kù)檢索
執(zhí)行精確質(zhì)量NIST庫(kù)檢索的操作與常規(guī)NIST庫(kù)檢索相同,,如圖2所示,在測(cè)試譜圖中啟動(dòng)NIST檢索,,該譜圖的檢索結(jié)果如圖10所示,。
圖10 精確質(zhì)量譜庫(kù)檢索結(jié)果
盡管該化合物在整數(shù)質(zhì)量譜庫(kù)和精確質(zhì)量譜庫(kù)中均有發(fā)現(xiàn),但使用精確質(zhì)量譜庫(kù)時(shí),,所有離子的精確質(zhì)量匹配更接近實(shí)際測(cè)量值,,精確質(zhì)量譜庫(kù)為檢索提供了更好的質(zhì)量準(zhǔn)確性匹配,因此檢索的匹配度比整數(shù)質(zhì)量譜庫(kù)更高,,從而提高了鑒定結(jié)果的可靠性,。
基于MassWorks校準(zhǔn)技術(shù)創(chuàng)建的精確質(zhì)量譜庫(kù),可以顯著增強(qiáng)GC/MS系統(tǒng)的鑒定能力,,無(wú)論是對(duì)存在明顯分子離子的化合物,,或是對(duì)于那些不具備分子離子或存在同分異構(gòu)體混淆情況的化合物。結(jié)合NIST譜庫(kù)檢索,,這種精確質(zhì)量譜庫(kù)方法有助于研究人員準(zhǔn)確,、高效地鑒定復(fù)雜樣品中的化合物,無(wú)論是在環(huán)境監(jiān)測(cè),、風(fēng)味分析,、食品安全檢測(cè)還是藥物代謝研究等領(lǐng)域,都有廣泛的應(yīng)用潛力,。
關(guān)于MassWorks 軟件
MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,,能幫助我們?cè)诘头直媛实乃臉O桿GC/MS、LC/MS直接測(cè)定化合物的精確質(zhì)量,并通過(guò)獨(dú)有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式,。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF,、Orbitrap)的定性分析。
關(guān)于綠綿科技
綠綿科技是Cerno Bioscience公司在中國(guó)區(qū)的總代理商,,負(fù)責(zé)Cerno公司旗下的MassWorks,、GC/ID 等產(chǎn)品市場(chǎng)推廣、銷售,、售前/售后技術(shù)支持,、應(yīng)用支持。
若您想了解獲取 MassWorks 產(chǎn)品的更多信息或應(yīng)用,,歡迎致電綠綿科技,!
關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡(jiǎn)稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務(wù)價(jià)值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實(shí)驗(yàn)室分析工作者提供樣品前處理,、樣品制備及分析,、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測(cè)的效率和水平,。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8
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