杜克雷嗜血桿菌全細(xì)胞溶解產(chǎn)物的LXQ測定
本文描述了快速和靈敏的對全細(xì)胞溶解產(chǎn)物分析方法,首先是快速簡單的1D-SDS PAGE分離,,然后是LXQ線性離子阱的LC/MSn分析,。數(shù)據(jù)清楚表明LXQ具有很好的分析速度和靈敏度,非常適合于分析蛋白質(zhì)復(fù)雜樣品,。延長的色譜梯度分離,,結(jié)合凝膠分離降低了樣品的復(fù)雜性,增加了SEQUEST可搜索MSn譜圖的數(shù)量,,隨后的蛋白質(zhì)識別可靠性,。在這個實驗中,45分鐘的運(yùn)行時間內(nèi)識別出79個蛋白質(zhì);梯度時間延長到150分鐘時,,可識別222種蛋白質(zhì);將全細(xì)胞溶解產(chǎn)物凝膠帶分隔成5個明顯的切片時,,利用150分鐘時間梯度,識別出360種蛋白質(zhì),。使用2D-凝膠分離經(jīng)常丟失的,,與發(fā)病機(jī)理相關(guān)的不同大、小膜蛋白和大分子蛋白質(zhì)也同樣被識別,。通過使用更長的時間梯度,,兩個分常大懸浮蛋白質(zhì)(>450 kDa)也被識別。
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