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23_在天然產(chǎn)物、香精香料、食品風(fēng)味及環(huán)境分析等領(lǐng)域中,如何借助

關(guān)鍵詞:綠綿科技
時間:2025-07-03 18:57:29

  在天然產(chǎn)物、香精香料、食品風(fēng)味分析、環(huán)境及車內(nèi)空氣分析等領(lǐng)域中,GC/MS是定性分析其中揮發(fā)性物質(zhì)的最常用、且最方便手段。在NIST、Wiley等數(shù)據(jù)庫的幫助下,我們可以輕松對GC/MS采集的未知物譜圖進(jìn)行搜庫,以確定可能的疑似物,然后再通過標(biāo)準(zhǔn)品對照來最終定性。但如果質(zhì)譜譜庫或數(shù)據(jù)庫本身沒有收錄的化合物——完全未知物,那要怎么來定性確定呢?

  傳統(tǒng)的鑒定思路是:1)使用高分辨率質(zhì)譜以獲取可能的分子式,結(jié)合EI-MS或運(yùn)行串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)得到碎片,以幫助推斷結(jié)構(gòu)。2)制備純化一定量的化合物,以便通過其他技術(shù)(核磁共振、紅外光譜等)進(jìn)行分析。3)或者購買/ 合成可能的化合物,GC/MS進(jìn)樣后通過保留時間匹配和質(zhì)譜圖對照來確定未知物。

  但這種傳統(tǒng)的鑒定方法過于繁瑣,而且需要使用到昂貴的高分辨質(zhì)譜儀,對于大多數(shù)只有四極桿GC/MS的用戶來說不切實(shí)際。

  今天我們將分享一種全新的、且更為簡單且經(jīng)濟(jì)的方法,它能在四極桿GC/MS上直接實(shí)現(xiàn)對”完全未知物“的結(jié)構(gòu)推測。

  ● 在MassWorks軟件中通過PFTBA標(biāo)樣校準(zhǔn)后的質(zhì)譜數(shù)據(jù)獲得精確質(zhì)量 /譜圖準(zhǔn)確度,從而得到未知物的分子式。

  ● 進(jìn)行NIST的 “Hybrid Search”,該檢索方法可查找數(shù)據(jù)庫中不存在但相關(guān)的化合物,確定化合物的結(jié)構(gòu)。

  ● 利用AI預(yù)測的保留指數(shù)(NIST AIRI),通過保留指數(shù)匹配進(jìn)行確認(rèn)或篩選。

GC/MS上的鑒定真正的未知物

  如圖1所示,未知峰13.88min,峰強(qiáng)度很高,提取的質(zhì)譜圖也表現(xiàn)為單一組分的純凈質(zhì)譜圖。我們同時也采集了C9-40的正構(gòu)烷烴系列混標(biāo)數(shù)據(jù)來進(jìn)行樣品數(shù)據(jù)的保留指數(shù)校正,該未知峰的實(shí)測保留指數(shù)RI=3329.8。

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圖1:13.88min處的未知峰及其質(zhì)譜圖(Pforile模式下采集)

  我們將該未知峰的質(zhì)譜圖發(fā)送至NIST譜庫進(jìn)行檢索,如圖2所示,排名第一的候選結(jié)果,其正/反檢索匹配值分別為763和839,得到的候選結(jié)果并不理想,且各個待選結(jié)果的保留指數(shù)也與譜庫收錄的保留指數(shù)存在非常大的差異,這就表明,NIST檢索對該未知峰并不適用。

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圖2:未知峰13.88min的NIST檢索結(jié)果并不理想,沒有正確的匹配

  接下來我們將嘗試采用新方法對該未知物進(jìn)行全面的分析。

  1. GC/MS結(jié)合MassWorks軟件測定精確分子量/分子式

  以Profile輪廓模式采集的GC/MS數(shù)據(jù),使用MassWorks軟件進(jìn)行校準(zhǔn),可獲得良好的質(zhì)量準(zhǔn)確度(約 ±10 mDa),與譜圖準(zhǔn)確度相結(jié)合,可實(shí)現(xiàn)幾 ppm 的有效質(zhì)量準(zhǔn)確度,并最終得到精確質(zhì)量和分子式。

  該未知峰在MassWorks軟件中由PFTBA標(biāo)樣校正后得到的精確質(zhì)量為450.4816,在±20mDa的質(zhì)量偏差內(nèi),設(shè)定元素組成為C、H、O、N,CLIPS search的分子式檢索共得到五個分子式,借助分子式同位素的譜圖準(zhǔn)確度(Spectral Accuracy),我們可以確定正確的分子式是第一個分子式,即C31H62O。

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圖3:未知物的精確質(zhì)量測定結(jié)果和分子式測定結(jié)果(左上:分子式結(jié)果;右上:精確質(zhì)量數(shù)和C31H62O的同位素匹配度;下:未知物的質(zhì)譜圖和分子離子)

  2. AIRI預(yù)測保留指數(shù)

  確定分子式為C31H62O后,我們在Pubchem數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行分子式檢索,嘗試找出所有可能的結(jié)構(gòu)。利用Cerno Bioscience 公司開發(fā)基于網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用程序,預(yù)測所有可能結(jié)構(gòu)的保留指數(shù)。

  如圖4所示,Pumchem檢索分子式,共有57種可能的化合物,將它們的AIRI在實(shí)測RI的±30范圍進(jìn)行篩選,剩下四個可能的化合物,但還不能確定到底哪一個正確的化合物。

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圖4:Pumchem檢索分子式得到的所有可能的結(jié)構(gòu)(左);將AIRI預(yù)測的保留指數(shù)用實(shí)測值±30過濾,剩下四個可能的結(jié)構(gòu)(右)

  3. NIST Hybrid Search得到結(jié)構(gòu)式

  在NIST中,我們將檢索模式切換為Hybrid Search模式,它可以幫助我們檢索出跟未知物結(jié)構(gòu)相似化合物,通過這些相似化合物我們有可能推測或得到未知物的結(jié)構(gòu)式。

  使用Hybrid Search需滿足如下條件:

  ● Hybrid Search可匹配碎片離子和中性丟失。

  ● 通過納入 “近鄰” 化合物來擴(kuò)展數(shù)據(jù)庫的范圍。

  ● 需要數(shù)據(jù)庫中存在相似的化合物。

  ● 必須知道名義分子量,最好還知道分子式。

  ● 質(zhì)量差異必須局限于分子的單個區(qū)域,且分子的碎裂行為為沒有顯著變化。

  ● Delta Mass 代表數(shù)據(jù)庫中化合物與未知分子之間的差異(修飾)。

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圖5:Hybrid search結(jié)果示例

  該未知峰在Hybrid Search檢索中,我們得到了三個匹配度非常高的直鏈烷酮化合物,這意味著該未知物與這三個烷酮化合物擁有著類似的分子結(jié)構(gòu)。結(jié)合我們在前面已經(jīng)確定的分子式C31H62O,我們推測該未知物是跟它們有著不同C原子數(shù)量的烷酮化合物。

  其結(jié)構(gòu)式預(yù)測如圖6左上圖所示。而這一分子式結(jié)構(gòu)剛好是Pubchem結(jié)果中剩余四個可能的待選之一。該結(jié)構(gòu)的預(yù)測AIRI保留指數(shù)為3320,與實(shí)測保留指數(shù)3329.8的差值為9.8。

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圖6:

  綜合MassWorks測定的精確質(zhì)量/分子式、基于Pubchem分子式結(jié)構(gòu)檢索和AIRI保留指數(shù)、Hybrid Search檢索結(jié)果,我們幾乎可以確定該未知物為2-Hentriacontanone,分子式為C31H62O。

  小結(jié):

  結(jié)合MassWorks軟件的精確質(zhì)量/分子式、保留指數(shù)和Hybrid Search檢索,是一種在單四極桿 GC/MS 上進(jìn)行未知物定性分析的簡單、快速的方法。

  對于不適合Hybrid Search的情況:我們?nèi)匀豢梢允褂帽A糁笖?shù) + 分子式鑒定來篩選未知化合物潛的潛在候選物。

  碎片分析也可用于驗(yàn)證鑒定結(jié)果(例如使用 NIST MS Interpreter)。

  為了保證結(jié)果的正確性,最終的化合物鑒定還是需要通過合成化合物來進(jìn)行確證。

  關(guān)于MassWorks 軟件

  MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們在低分辨率的四極桿GC/MS、LC/MS直接測定化合物的精確質(zhì)量,并通過獨(dú)有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF、Orbitrap)的定性分析。


關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務(wù)價值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實(shí)驗(yàn)室分析工作者提供樣品前處理、樣品制備及分析、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測的效率和水平。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8 E-mail:[email protected]