未知物分析:在單四極桿GC/MS上鑒定譜庫中未收錄化合物的策略
GC/MS中的完全未知物的定性分析
GC/MS分析完全未知的化合物,是指未收錄于 GC/MS 數(shù)據(jù)庫中的化合物,。
化合物的鑒定很重要,,但傳統(tǒng)的鑒定方法十分繁瑣。
使用高分辨率質(zhì)譜儀以獲取可能的分子式
可能需要進行 “軟” 電離,。
運行串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)以幫助推斷結(jié)構(gòu),。
分離出一定量的化合物,以便通過其他技術(shù)(核磁共振,、紅外光譜等)進行分析,。
購買 / 合成可能的化合物,運行 GC/MS,,并匹配保留時間和質(zhì)譜圖,。
是否存在更快速、更經(jīng)濟的方法,?
單四極桿 GC/MS 分析中,,有哪些方法可用于進行譜庫未收錄化合物的鑒定?
通過利用校準后的質(zhì)譜數(shù)據(jù)獲得精確質(zhì)量 / 譜圖準確度,,從而得到分子式,。
進行NIST的 “Hybrid Search”,,該檢索方法可查找數(shù)據(jù)庫中不存在但相關(guān)的化合物。
利用AI預測的保留指數(shù)(NIST AIRI),,通過保留指數(shù)進行確認或篩選,。
四極桿上GC/MS的分子式鑒定——由MassWorks軟件輔助
校準后的Profile輪廓模式數(shù)據(jù)可提供良好的質(zhì)量準確度(約 ±10 mDa),與譜圖準確度相結(jié)合,,可實現(xiàn)幾 ppm 的有效質(zhì)量準確度,。
操作簡單。
以Profile輪廓模式運行數(shù)據(jù),。
在運行結(jié)束時短暫開啟質(zhì)譜調(diào)諧液(全氟三丁胺,,PFTBA)。
軟件會自動校準數(shù)據(jù),。
數(shù)據(jù)分析由MassWorks軟件來完成,,最終得到精確質(zhì)量和分子式。
四極桿GC/MS在Profile輪廓圖模式下測定化合物的精確質(zhì)量,,并通過理論同位素峰(綠色)和樣品校正同位素(紅色)的譜圖準確度識別出正確的分子式
混合檢索:Hybrid Search
Hybrid Search可匹配碎片離子和中性丟失,。
通過納入 “近鄰” 化合物來擴展數(shù)據(jù)庫的范圍。
需要數(shù)據(jù)庫中存在相似的化合物,。
必須知道名義分子量,,最好還知道分子式。
質(zhì)量差異必須局限于分子的單個區(qū)域,,且分子的碎裂行為為沒有顯著變化,。
Delta Mass 代表數(shù)據(jù)庫中化合物與未知分子之間的差異(修飾)。
混合檢索Hybrid search結(jié)果示例
保留指數(shù)校準
保留指數(shù)可以用于定性分析未知化合物,,它比保留時間更可靠,,因為它只與固定相類別和柱溫有關(guān),受其他因素影響較小?,。
保留指數(shù)通??捎烧龢?gòu)烷系列混合標樣進樣后校正得到,還有一種新的方法——可以通過保留指數(shù)自動校正技術(shù)(如Auto RI,,GC/ID)來計算保留指數(shù),。
保留指數(shù)定性的前提是已經(jīng)有目標的保留指數(shù)相關(guān)的報道,這樣我們才能通過核對保留指數(shù)來定性,。
NIST中譜庫中并不是每個化合物都有計算的保留指數(shù)值,,但可以通過AIRI來預測化合物的保留指數(shù)。
正構(gòu)烷烴系列混標校正計算保留指數(shù)
什么是 AIRI,?
NIST 使用其廣泛的數(shù)據(jù)庫測量保留指數(shù)數(shù)據(jù)作為訓練集,,通過化合物結(jié)構(gòu)預測任何化合物的保留指數(shù)。
AIRI 的源代碼和模型由 NIST 發(fā)布。但是,,設(shè)置過程很繁瑣,。
Cerno Bioscience 公司正在開發(fā)基于網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用程序,通過化合物結(jié)構(gòu)預測保留指數(shù),,讓所有人都能輕松使用 AIRI,。
AIRI的參考文獻: Predicting Retention Indices and Their Uncertainties Using Artificial Intelligence, Geer, Stein, Mallard, and Slotta,Journal of Chemical Information and Modeling 2024 64 (3),690-696.
方法示例
13.88 分鐘處的未知峰很強且純凈:
盡管如此,但檢索結(jié)果卻很差:
我們可以使用校準后的GC/MS數(shù)據(jù)確定分子量和分子式:
AIRI預測保留指數(shù):
Hybrid Search 混合檢索結(jié)果:
小結(jié):
結(jié)合分子式鑒定,、保留指數(shù)和Hybrid Search混合檢索,,是一種在單四極桿 GC/MS 上進行未知物定性分析的簡單、快速的方法,。
對于不適合混合檢索的情況:
我們?nèi)匀豢梢允褂帽A糁笖?shù) + 分子式鑒定來篩選未知化合物潛的潛在候選物,。
四極桿GC/MS的分子式鑒定由MassWorks軟件來完成。
碎片分析也可用于驗證鑒定結(jié)果(例如使用 NIST MS Interpreter),。
最終的化合物鑒定還是需要通過合成化合物來進行確證,。
關(guān)于MassWorks 軟件
MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們在低分辨率的四極桿GC/MS,、LC/MS直接測定化合物的精確質(zhì)量,,并通過獨有的譜圖準確度概念確定出準確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF,、Orbitrap)的定性分析,。
關(guān)于綠綿科技
北京綠綿科技有限公司(簡稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務(wù)價值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實驗室分析工作者提供樣品前處理,、樣品制備及分析,、實驗數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測的效率和水平,。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8
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